Симбионты, космические захватчики оккупировали Землю. Военные вместе с Человеком-пауком, пытаются оказать сопротивление. Но внутренние противники главного героя сильнее, чем захватнические силы. Вспоминая обрывки разговоров он не может сделать выбор. Но симбионты призывают его действовать, нападая на людей они заражают их частью своей жижи, которая попала и Человека-Паука во время встречи с Мэри Джейн и Кейджом придав ему возможность облачаться в черный симбиотический костюм, также как и несколькими днями раньше во время боя с Эдди Броком, когда часть его жижи перебралась на героя, придав ему особую силу чтобы защитить Мэри Джейн и одолеть Брока. Но кто будет собирать все спрятанные значки и играть с самого начала, когда можно воспользоваться 100% прохождением.

Полный список особенностей сохранения:
Это сохранение не с самого начала, оно сделано на миссии где Человек-паук только встретился с Люком Кейджом. Если необходимо пройти игру заново со всеми открытыми комбо и пауками, собранными в городе, то по окончанию игры нужно дождаться конца титров. Игрока выкинет на рабочий стол (это нормально). Потом снова нужно запустить игру, далее нажать continue (продолжить), и можно приступить к новой игре со всеми открытыми достижениями!
— Открыты все комбо и собраны все пауки в городе